Eppendorf AF2200 Plate Reader - Manual (Page 4)

Table of contents
Eppendorf
® PlateReader AF2200
English (EN)
4
6 Predefined methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
6.1
Method selection. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
6.2 Method description . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.2.1
Nucleic acid quantification (UV 260 nm microvolume) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.2.2 Nucleic acid quantification (UV 260 nm with factor) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.2.3 Nucleic acid quantification (UV 260 nm with standards) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
6.2.4 Nucleic acid quantification (Fluorescence 485/535 nm with standards) . . . . . . . . . . . 59
6.2.5 Protein quantification BCA, Bradford, Lowry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
6.2.6 Protein quantification (NanoOrange 485/595 nm with standards) . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.2.7 Cell viability (CellTiter-Blue Assay). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.2.8 Cell viability (Apo-ONE Caspase-3/7 Assay) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
6.3 Method (measurement) parameters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
6.4 Method results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
6.4.1
Contents of the raw data sheet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
6.4.2 Contents of the blanking sheet (factor methods only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
6.4.3 Content of the results sheet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
7 Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
7.1
General Troubleshooting. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
7.2 Troubleshooting Absorbance mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
7.3 Troubleshooting Fluorescence mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
7.4 Save method scripts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
7.5 Save method results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
8 Evaluation procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
8.1
Nucleic acid quantification UV 260 nm with factor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
8.2 Nucleic acid and Protein quantification with standards . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
8.3 Protein quantification Nano Orange 485/595 nm with standards . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
8.4 Cell viability CellTiter-Blue Assay, Cell viability Apo-ONE Caspase-3/7 Assay . . . . . . . . . . . . . 75