Bio-Rad Image Lab™ Software - Manual (Page 6)

vi | ChemiDoc MP Imaging System with Image Lab Software
Table of Contents
Chapter 6 Analyzing Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
Image Types . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
Using Auto Analysis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
Analysis Tool Box Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 129
Image Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130
Correcting a Slanted Gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131
Cropping a Gel Image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131
Inverting Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132
Merging Images. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132
Lane and Bands Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
Detecting Lanes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
Using the All Lanes and Single Lane Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
Copying Lanes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
Detecting Bands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138
Editing the Detected Bands. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142
Normalizing Volume Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143
Using the Normalization Tool . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144
Optimizing Normalization of Volume Data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Detect the Lanes in the Channels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146
Make Adjustments to the Lanes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146
Detect the Bands. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Subtract any Extraneous Background . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149
Remove Compromised Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149
View the Data in the Analysis Table . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150
Adding a Channel to a Single Image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151
Molecular Weight (MW) Analysis Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154
Quantity Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 160
Annotation Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166
Add Annotations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167
Alignment. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167
Text Properties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
Color . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
Rotate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
Volume Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169